Sekolah Menengah Kejuruan Yos Sudarso Ende didirikan pada tahun 1968, didirikan dengan nama SMEA Yos Sudarso bidang keahlian Bisnis dan Manajemen diantaranya kompetensi keahlian :

1. Administrasi Perkantoran (sekarang Manajemen Perkantoran dan Layanan Bisnis)
2. Akuntansi (sekarang Akuntansi dan Keuangan Lembaga)
3. Pemasaran (sekarang Pemasaran)

      Seiring berjalannya waktu pada tahun 2010, SMK Yos udarso Ende menambah bidang keahlian Teknik Informasi dan Komunikasi dengan kompetensi keahlian yang dipilih Teknik Komputer dan Jaringan (sekarang Teknik Jaringan Komputer dan Telekomunikasi). Kini keempat program keahlian tersebut telah terakreditasi B.